Ingénieur d'Etudes et Développement - Spécialiste Bio-Informatique
Catégorie :
Informatique
Date de dernière mise à jour :
7 septembre 2008
Lieu :
CV :
OBJECTIFS
Travailler à l’interface des services informatique et scientifique pour l’étude et la réalisation de solutions informatiques dans le cadre de la recherche pharmaceutique.
EXPERIENCE PROFESSIONNELLE
Depuis 2006
Datavance - Ingénieur d’Etudes
Mission au sein du service Informatique de l'Institut de Recherche Servier - Equipe Bio-informatique.
Administrateur SRS (Logiciel d’intégration de données et d’outils dédiés à la bio-informatique).
Développement Java : Conception de modules métiers pour le progiciel KDE (outil de data-pipelining).
Support utilisateur.
Avril 2005 – Janvier 2006
Institut de Recherche Servier - Cadre Technique
Bio-informaticien au sein de la division de Physiopathologie et Pharmacologie Moléculaire.
Mise en place d'une procédure de validation et d'annotation des essais de PCR quantitative "Applied Biosystems".
Rédaction de spécifications fonctionnelles et recette.
Encadrement d'un stagiaire de D.E.S.S.
Septembre 2004 – Avril 2005
Randstad Work Solutions - Cadre Technique
Mission à l’Institut de Rechercher Servier - Division de Physiopathologie et Pharmacologie Moléculaire.
Conception d’une interface de requêtes pour la visualisation des résultats d’annotations des oligonucléotides spottés sur les puces à ADN Agilent.
Développement Perl et KDE.
STAGES
Mars – Septembre 2004
Institut de Recherche Servier
Réalisation d'un workflow d'annotation fonctionnelle des oligonucléotides de puces à ADN "Agilent".
Développement Perl et KDE
Mars – Septembre 2003
Biosiris S.A. (Belgique)
Conception d’un programme de visualisation et d’analyse des amas hydrophobes dans les séquences protéiques selon la méthode HCA.
Développement C++ (MFC, OpenGL)
Février – Mars 2002
LaMI, CNRS UMR 8042
Réalisation d’annotateurs de séquences d’ADN basés sur la fréquence d’apparition de triplets dans les régions codantes.
Juillet – Aout 2001
INSERM U370 – Hôpital Necker
Recherche d’une propriété mitogène et anti-apoptotique de la protéine HIP/PAP
FORMATION
2003 - 2004 DESS Bio-Informatique Université Paul Sabatier Toulouse
Mention Bien
2000 - 2003 IUP Génie Biologique et Informatique Université d’Evry
Mention Assez Bien
1999 - 2000 DEUG Science de la Vie Université de RouenMention Bien
INFORMATIQUE
Systèmes d’exploitation :
Windows : 2003, XP
Unix : Sun Solaris 9, Linux
Programmation :
Langages orientés objet : Java, C#
Langages de Script : PERL, Groovy, JavaScript
Technologies Web : ASP.NET 2.0, Web-Services
Bases de Données : Oracle (PL/SQL), MySQL IDE : Eclipse 3.2, Visual Studio 2005, Komodo 3.5 Professional Gestionnaire de sources : CVS, Subversion
BIO-INFORMATIQUE
Knowledge Discovery Environment (KDE), InforSense.
SRS, Biowisdom.Biofacet, GenomeQuest Inc.
DS-GCG, Accelrys.
Pack EMBOSS, BLAST, Clustal, HMM.
Connaissance approfondie des banques de données biologiques publiques et privées.
LANGUES
Anglais : Bon niveau, lu, écrit et parlé.
Espagnol : Notions.
ACTIVITES EXTRA PROFESSIONNELLES
Cofondateur du club d’Ultimate Frisbee de Montrouge (Association loi 1901).
Club fondé en janvier 2006 : 27 inscrits pour la saison 2006/2007, participation aux championnats et tournois régionaux.
Membre secrétaire et webmaster du club.
Remarques :
Disponibilité : 3 mois
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