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Biométrie/ Biostats

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Ingénieur biostatisticien - bioinformaticien
Catégorie :

Biométrie/ Biostats

Date de dernière mise à jour :

13 mars 2011

Lieu :

France

CV :

---- FORMATION ----

2004 : Mastère Spécialisé en Bio-Informatique, Conservatoire National des Arts et Métiers – Institut d’Informatique d’Entreprise, Evry.

2003 : DESS Mathématiques et Statistiques pour la Biologie, Université Paris 5.

2002 : Maîtrise de Sciences et Techniques en Informatique et Statistiques Appliquées aux Sciences de l’Homme, Université Paris 5.

2000 : DUT Statistiques et Traitement Informatique des Données, IUT Paris 5.


---- EXPERIENCES PROFESSIONNELLES ----

Depuis oct 2009 : Intitut Gustave Roussy - Service de Biostatistiques et d'Epidémiologie.
Pratique de la recherche clinique en cancérologie pour l’analyse d’essais thérapeutiques de phase II ou III, d’enquêtes pronostiques ou d’études diagnostiques.
Programmation des analyses statistiques (SAS). Rapport d’analyse avec interprétation des résultats.
Présentation des résultats aux cliniciens. Participation à la rédaction de protocoles d’études et d’articles scientifiques.
Génomique : Adaptation des méthodes statistiques pour l’identification de biomarqueurs prédictifs et de nouvelles cibles thérapeutiques dans les cancers du sein. Etude des mécanismes d’épissages alternatifs spécifiques du cancer du sein à l’aide de puces exons.

2006-2009 : CNRS - Centre de Génétique Moléculaire
Analyse statistique des données de puces à ADN générées par les différents projets scientifiques.
Elaboration des schémas expérimentaux, ingénierie de projets.
Définition des stratégies d’analyse. Diffusion des résultats.
Développement d’outils statistiques et bioinformatiques (package R "MAnGO") pour le traitement et l’analyse des données de microarrays.
Responsable de la base de données "BASE" spécifique aux puces à ADN. Chargé du
développement, maintenance, gestion et évolution de la base de données.
Mise en place d’un interfaçage de l’outil MAnGO avec BASE.
Rédaction de protocoles, documents techniques et méthodologiques dans le cadre de la démarche qualité de la plate-forme.
Participation à la veille technologique en bioinformatique et biostatistique.

2004-2006 : CEA - Service de Génomique Fonctionnelle.
Analyse des données de puces à ADN de la plate-forme transcriptome, et développement d’outils bioinformatiques pour le traitement statistique des données (Java, R/BioConductor). Conception des dessins expérimentaux. Rédaction de documents techniques et méthodologiques. Participation à la veille technologique du groupe en bioinformatique et biostatistique.

2003 : Stage de DESS - INSERM Service de Biostatistique, Hôpital Saint Louis
Etude des approches biostatistiques pour l'analyse de données de survie en présence de compétition.
Développement d'un plug-in avec interface graphique pour le logiciel SPSS permettant l'analyse de données de survie en présence de compétition (VB, R, Fortran, SPSS).

Remarques :

Activités d'enseignement

2009 – Master Ingénierie Mathématique pour les Sciences du Vivant, Université Paris 5. Cours (6h) : "Les outils statistiques et bioinformatiques pour le traitement des données de puces à ADN".

2008 – Formation CNRS (1 semaine) et formation Master (Universités Orsay / Versailles – 3 semaines) organisées sur la plate-forme Puces à ADN Gif/Orsay. "Analyse des données de biopuces".
Cours/TP : langage R (6h), analyse de variance pour les microarrays (3h), normalisation (3h), analyse différentielle (6h), classification (3h), enrichissement fonctionnel (3h).

2008/2009 – Formations internes (plusieurs sessions) dans le cadre de projets scientifiques menés sur la Plate-forme Puces à ADN Gif/Orsay (collaborateurs – chercheurs, ingénieurs, étudiants).
• Analyse de données de puces à ADN et applications avec l’outil MAnGO (1 journée)
• Intégration de données dans la base de données transcriptome "BASE" (1 journée)

Encadrement d’étudiants :
• 2009 – 3ème année d’Ecole d’ingénieurs Sup’Biotech – 3 étudiants (stage de 3 mois)
• 2008 – Master Biologie-Informatique, Université Paris 7 – 1 étudiant (stage de 4 mois)

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